崇州二医院是一所集医、教、研、康复、预防保健为一体的三级综合医院，。当前开放床位600张，设置科室44个。骨科、康复科、超声医学、神经外科、肾病科、胸外科、运动医学科、烧伤科、高压氧科为崇州市专业质量控制中心。

崇州二医院于2022年成立药物器械临床研究中心，并于12月完成国家医疗器械临床研究机构备案，备案专业7个（内科-心血管内科专业、康复医学科、医学检验科-临床体液、血液专业、医学检验科-临床微生物学专业、医学检验科-临床化学检验专业、医学检验科-临床免疫、血清学专业、医学检验科-临床细胞分子遗传学专业）；并于2023年4月完成国家药物临床研究机构备案，备案1各专业（内科-心血管内科专业）。

中心以建设国际标准的临床研究服务体系,促进我国医药健康产业高质量发展为目标,以加强临床研究团队建设、规范临床研究服务、提高临床研究质量、加快临床研究速度为己任。同时,加快临床研究重点领域突破、推进生物治疗技术和重大创新产品临床应用、支撑前沿医疗技术升级。

中心拟通过聚集“医政产学研资”资源优势,促进临床研究资源共享;通过临床研究培训及人才培养、临床研究方案设计及项目信息咨询、注册临床试验项目监查与稽查、临床研究信息管理及服务、受试者招募等CRO和SMO服务,为医药创新产品研发和临床转化提供临床研究全过程专业化服务。